故事講述一個看起來非常平凡的幼稚園學生松崎小美有一個不可告人的秘密 ── 那就是她在自己的臥室里和一群不可思議的迷你動物生活著：天真活潑的小爾、喜歡胡鬧的健太以及永不疲倦的依沙。他們是從異次元空間“動物橫町”來的居民，不知何時在小美新家的臥室里建造了一扇可通往動物橫町的秘密之門。而動物橫町的其他角色也隨之一一登場……
